LabDAO trasează viitorul AI open-source pentru descoperirea medicamentelor

Proiectul Folding@home a făcut titluri pe toată durata pandemiei de COVID-19 pentru gruparea puterii de calcul neutilizate pentru a explora spațiul de căutare a plierii proteinelor pentru a aborda noul coronavirus. Dând putere cetățenilor să fie oameni de știință în sine, inițiativa a desfășurat simulări la scară largă ale diferitelor configurații moleculare ale proteinelor într-o rețea distribuită de computere „înscrise” din întreaga lume.

Această paradigmă descentralizată a fost vestită pentru a aduce oamenii împreună în jurul unei probleme comune și a aproviziona eficient puterea de calcul, dar ce se întâmplă dacă puterea de calcul și infrastructura de rezolvare a problemelor ar fi inversate? Cu alte cuvinte, ce ar fi dacă indivizii și-ar putea conduce propriile proiecte prin folosirea puterii de calcul acumulate și instrumentele pentru experimentarea biologică să pornească?

LabDAO transformă acest vis în realitate cu Platforma PLEX. PLEX este un instrument de linie de comandă open-source conceput pentru a face nu numai resursele de calcul, ci și o varietate de instrumente de învățare biologică-mașină (numită suita „BioML” în cadrul LabDAO) accesibile într-o varietate de medii. Fie că experimentează cu propriile simulări de andocare a moleculelor mici sau de pliere a proteinelor, PLEX permite utilizatorilor să acceseze biblioteca de instrumente a LabDAO, să partajeze rezultate și să le vizualizeze în mai puțin de cinci minute.

Această suită de instrumente și platforma sa de utilizare de pe deasupra au fost expuse la summitul Blockchain Meets Biology de la Zuzalu la începutul lunii aprilie, unde Lily Hansen-Gillis, membru al echipei de bază LabDAO, a demonstrat de la început până la sfârșit o simulare a dinamicii moleculare interne a unui proteine ​​pentru a-și găsi configurația cea mai stabilă. Apoi, în calitate de „non-coder”, ea a condus publicul de la început până la sfârșit – totul cu un computer, WiFi, PLEX pe linia de comandă și nimic mai mult.

Mai larg, LabDAO este o platformă descentralizată activată pentru web3 (parte a mișcării mai mari „DeSci”) angajată să creeze un mediu mai productiv pentru descoperirea de medicamente cu sursă deschisă. Punând la dispoziție instrumente și resurse de ultimă oră pentru un ecosistem mai larg, LabDAO își propune să creeze mediul potrivit pentru progrese științifice transparente și accesibile. Fie prin eliminarea nevoii cercetătorilor de a avea propriul hardware sau infrastructură de calcul sau publicarea rezultatelor experimentelor pe un registru blockchain astfel încât acestea să fie tratabile și reproductibile, organizația se angajează să facă posibilă mai multă inovație prin colaborare - eliminând barierele cauzate de săraci. uzabilitate și expertiză de nișă.

Eforturile LabDAO de a construi această lume DeSci a viitorului pentru astăzi au primit recent un impuls sub forma unei runde de finanțare de 3.6 milioane USD de la diverse alte DAO, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan și alții. Acest aflux de sprijin va contribui la eforturile continue de a construi instrumente software open-source și de a consolida ecosistemul de cercetare al LabDAO.

În ceea ce privește PLEX în sine, următorii pași imediati la orizont includ testarea platformei în diferite colaborări științifice, containerizarea diverselor instrumente și acumularea hardware-ului necesar pentru a promova rețeaua BioML.

În ceea ce privește pe termen lung, poate că următorul medicament care salvează vieți în timpul următorului focar major de boală infecțioasă va fi proiectat cu puterea PLEX, un pas înainte descentralizat la un moment dat. Pe măsură ce ecosistemul continuă să crească, doar timpul ne va spune.

Mulțumesc Aishani Aatresh pentru cercetări suplimentare și raportări despre acest articol. Sunt fondatorul SynBioBeta, iar unele dintre companiile despre care scriu sunt sponsori ai Conferință SynBioBeta. Pentru mai mult conținut, vă puteți abona la buletinul meu săptămânal.